Uso de codones sinónimos

Los genes contienen la información necesaria para establecer la cantidad y el orden de los amino ácidos en las proteínas. Hasta hace unos años era comúnmente aceptado que los sitios de los genes que no contribuyen a la codificación de la cadena de aminoácidos en las proteínas, eran neutros para la selección natural y podían variar libremente de acuerdo con los patrones de mutación. Tal es el caso de los sitios sinónimos. Las proteínas están formadas por 20 aminoácidos diferentes. La traducción del gene a proteína se realiza con base en el código genético, cada conjunto de tres nucleótidos codifica para un amino ácido. Debido a que solo hay 4 nucleótidos que pueden formar 64 tripletes (tres de ellos no codifican ningún amino ácido) y solo hay 20 amino ácidos, varios amino ácidos son codificados por más de un triplete (codones sinónimos). Los sitios sinónimos son aquellos nucleótidos dentro de las regiones que codifican proteínas que pueden variar sin modificar la secuencia de aminoácidos que se produce.